A pedagogical view about the design of isoxazolyl-penicillins of the ampc betalactamase receptor 1fcm using the docking molecular technique

Revista Boletín Redipe

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Title A pedagogical view about the design of isoxazolyl-penicillins of the ampc betalactamase receptor 1fcm using the docking molecular technique
Una mirada pedagógica sobre el diseño de isoxazolil-penicilinas del receptor 1fcm de la betalactamasa ampc empleando la técnica de acoplamiento molecular
 
Creator Heredia Parra, Laura Alejandra
Vigoya Ovalle, Edson Armando
Ramírez Valencia, Astrid
Peña Prieto, Luis Eduardo
 
Subject Cloxacillin
Isoxazolyl penicillins
Betalactamase
Molecular docking
Cloxacilina
Isoxazolil penicilinas
Betalactamasa
Docking molecular
 
Description The present work mainly exposes the result of the search for molecules, derived from the structural changes of the drug Cloxacillin in its phenyl radical, which is chlorinated, likewise, the selection of the pharmacophore group is evidenced, which allowed to specify the aforementioned objective. Secondly, the selected target was beta-lactamase, with 1FCM nomenclature, registered in the database, Protein Data Bank, in the same way, the amino acids involved in non-covalent interactions are found, in this order of ideas, they were raised, 22 molecules that presented an affinity energy lower than -8.0 Kcal/mol, this data stated above, will become the reference value, to postulate 6 molecules that have registered a lower affinity, generated by the Autodock Vina software. To conclude, the structural optimization of the leading drug is given as a result, together with its new interactions in the amino acids LYS64, ASN149, THR313 and SER61.
El presente trabajo expone Expone principalmente el resultado de la búsqueda de moléculas, derivadas de los cambios estructurales del fármaco Cloxacilina en su radical fenilo, el cual se encuentra clorado. Así mismo, pone en evidencia la selección del grupo farmacóforo, el cual permitió concretar el objetivo anteriormente mencionado. En segundo lugar, el target seleccionado fue la betalactamasa, con nomenclatura 1FCM, registrada en la base de datos, Protein Data Bank. De igual manera se encuentran los aminoácidos involucrados en las interacciones no covalentes. En este orden de ideas, se plantearon 22 moléculas que presentaron una energía de afinidad menor a -8.0 Kcal/mol, dato que sirve de referencia para postular 6 moléculas que hayan registrado una afinidad menor, generada por el software autodock vina. Finalmente, como resultado se obtiene la optimización estructural del fármaco líder junto con sus nuevas interacciones en los aminoácidos LYS64, ASN149, THR313 y SER61.
 
Publisher Red Iberoamericana de Pedagogía
 
Date 2021-09-14
 
Type info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
 
Format application/pdf
 
Identifier http://revista.redipe.org/index.php/1/article/view/1432
 
Source Boletín Redipe; Vol. 10 No. 9 (2021): Concepts and practices of learning and training; 121-137
Revista Boletín Redipe; Vol. 10 Núm. 9 (2021): Concepciones y prácticas de aprendizaje y formación; 121-137
2256-1536
 
Language eng
 
Relation http://revista.redipe.org/index.php/1/article/view/1432/1350
 
Rights http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0
 

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