Integration of Bioinformatics Tools and Molecular Biology Methods for the design of a COVID-19 Test Kit: An Example of Significant Learning

Revista Mutis

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Title Integration of Bioinformatics Tools and Molecular Biology Methods for the design of a COVID-19 Test Kit: An Example of Significant Learning
Integración de herramientas bioinformáticas y métodos en biología molecular para el diseño de un kit diagnóstico del COVID-19: un ejemplo de aprendizaje significativo
 
Creator Rivera Forero, Catalina
Yáñez Dukon, Luis Alejandro
Herrera Khenayzir , Carolina
Arias , Juan Carlos
Niño Vargas , Jonathan
Rodríguez Becerra, Pilar
Leal Mejía, Leslie
Hernández Fernández, Javier
 
Subject RT-qPCR
SARS COV 2
pandemic
coronavirus
contextualized education
RT-qPCR
SARS COV 2
pandemia
coronavirus
educación contextualizada
 
Description As a pedagogical form of active learning, topics developed in molecular biology class were related to the coronavirus COVID-19 pandemic that is currently advancing in almost the entire planet. Having an efficient method of diagnosing infection during the onset of this acute respiratory infection is important in detecting both symptomatic and asymptomatic patients. For this reason, seventh semester students from marine and environmental biology courses studying molecular biology at the University of Bogotá Jorge Tadeo Lozano were challenged to design a diagnostic method for the COVID-19 virus based on RT PCR and qPCR. The objective of this academic exercise was to encourage students to propose an effective method to detect the COVID-19 virus using the knowledge acquired during the course. A review of the previous literature was carried out to identify the existing methods for the detection of the virus and, with the help of bioinformatic tools, the analysis of the sequences of the genomes of COVID-19, human SARS and bat SARS available at GenBank was carried out.
Como una forma pedagógica de aprendizaje activo, se relacionaron temas desarrollados en clase de biología molecular con la pandemia del coronavirus COVID-19 que en este momento avanza en casi la totalidad del planeta. Contar con un método eficiente para diagnosticar la infección durante el inicio de esta infección respiratoria aguda es importante para detectar tanto los pacientes sintomáticos como los asintomáticos. Por este motivo, se retó a los estudiantes de séptimo semestre de las carreras de biología marina y ambiental que cursan la materia biología molecular en la Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano a diseñar un método diagnóstico para el virus COVID 19 basado en RT PCR y qPCR. El objetivo de este ejercicio académico consistió en incentivar a los estudiantes para que propusieran un método efectivo que permita detectar el virus COVID 19 a través de los conocimientos adquiridos durante el curso. Se realizó una revisión de la literatura previa para identificar los métodos existentes para la detección del virus y con ayuda de herramientas bioinformáticas se realizó el análisis de las secuencias de los genomas del COVID 19, el SARS humano y el SARS de murciélago disponibles en GenBank.
 
Publisher Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano
 
Date 2019-12-31
 
Type info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
 
Format application/pdf
 
Identifier https://revistas.utadeo.edu.co/index.php/mutis/article/view/1599
10.21789/22561498.1599
 
Source Revista Mutis; Vol. 9 Núm. 2 (2019); 62-80
Revista Mutis; Vol 9 No 2 (2019); 62-80
2256-1498
 
Language spa
 
Relation https://revistas.utadeo.edu.co/index.php/mutis/article/view/1599/1559
 
Rights Derechos de autor 2020 Revista Mutis
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0
 

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