Studi in Silico Prediksi Potensi 6-Gingerol sebagai inhibitor c-Jun N-terminal kinases (JNK)
Jurnal Jejaring Matematika dan Sains
View Publication InfoField | Value | |
Title |
Studi in Silico Prediksi Potensi 6-Gingerol sebagai inhibitor c-Jun N-terminal kinases (JNK)
|
|
Creator |
Bare, Yohanes
Maulidi, Andri Sari, Dewi Ratih Tirto Tiring, Sri Sulystyaningsih Natalia Daeng |
|
Subject |
6-gingerol
DMT2 JNK Revolusi Industri 4.0 |
|
Description |
Revolusi industri 4.0 mendorong pendidikan harus sesuai perkembangan teknologi. Penggunaan in silico merupakan metode dalam bidang biologi yang menggunakan komputer dan internet dalam kajiannya. Penyembuhan penyakit diabetes melitus tipe 2 (DMT2) menjadi perhatian dalam kajian in silico. Senyawa 6-gingerol dari jahe diinteraksikan dengan protein JNK. Tujuan dari penelitian dari penelitian ini untuk menganalsisi potensi 6-gingerol sebagai inhibitor JNK. Penelitian ini menggunakan metode in silico. Protein JNK (ID: 464Y) diperoleh dari Protein Data Bank (PDB) sedangkan ligan 6-gingerol (CID: 44559528) diperoleh dari database PubChem. Ligan dan protein diinteraksikan menggunakan HEX 8.0.0, visualisasi dan analisis data menggunakan Discovery studi client 4.1. Analisis yang dikaji adalah jumalah residu asam amino yang berinteraksi dengan JNK, ikatan hidrogen, dan energi yang dibentuk. Interaksi 6-gingerol dan JNK terdapat dua residu Arg107 dengan ikatan hidropobik dan Ser217 dengan ikatan hydrogen. Gaya van der Waals yang terbentuk pada residu asam amino ALA74, GLN75, ALA211, ALA214, LYS106, THR213, THR103, GLN1022, GLU384, dan HIS104. Energi yang terbentuk adalah -299.65cal/mol. Ligan 6-gingerol diprediksi memiliki potensi sebagai inhibitor JNK.
|
|
Publisher |
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Palangka Raya
|
|
Date |
2019-12-31
|
|
Type |
info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion Peer-reviewed Article |
|
Format |
application/pdf
|
|
Identifier |
http://e-journal.upr.ac.id/index.php/JMS/article/view/540
10.36873/jjms.v1i2.211 |
|
Source |
Jurnal Jejaring Matematika dan Sains; Vol 1 No 2 (2019): Edisi Desember 2019; 59-63
2686-1658 |
|
Language |
eng
|
|
Relation |
http://e-journal.upr.ac.id/index.php/JMS/article/view/540/478
|
|
Rights |
Copyright (c) 2019 Jurnal Jejaring Matematika dan Sains
|
|