Distinction of species of the genus Persea by RAPD and ISSR DNA markers1

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Title Distinction of species of the genus Persea by RAPD and ISSR DNA markers1
Distinción de especies del género Persea mediante RAPD e ISSR de ADN1
 
Creator Reyes-Alemán, Juan Carlos
Valadez-Moctezuma, Ernestina
Simuta-Velázco, Lisandro
Barrientos-Priego, Alejandro Facundo
Gallegos-Vázquez, Clemente
 
Description With the aim of establishing a basis to differentiate part of the Persea genetic diversity, specially of the subgenus Persea maintained in the National Avocado Germplasm Repository of Mexico, eight species were studied (P. americana, P. steyermarkii, P. schiedeana, P. lingue, P. nubigena, P. floccosa,P.cinerascensyP.indica)withmolecularmarkers by means of RAPD and ISSR techniques, where the PCR products were separated in acrylamide gels. The DNA fingerprinting was analyzed with multivariate statistical methods and bootstrapping to establish their genomic relationships. Useful DNA polymorphic fragments were found for the inter and intra-specific distinction of the eight species of Persea considered in the study. The statistical analysisoftheDNAfingerprintsbymeansofRAPDgrouped the different species congruently with the actual taxonomic classification,comparedwithISSR.Accordingtothepresent study, P. indica y P. lingue show less genomic relationship with the rest of the species studied, and this is accordance to the fact that they correspond to the subgenus Eriodaphne. The results permitted to differentiate genotypes of the different species of the subgenus Persea that includes P. americana and an inter-specific hybrid included in the study.
Con la finalidad de establecer bases para diferenciar parte de la diversidad genética de Persea y en especial del subgénero Persea resguardado en la colección nacional de germoplasma de aguacate de México, se estudiaron ocho especies (P. americana, P. steyermarkii, P. schiedeana, P. lingue, P. nubigena, P. floccosa, P. cinerascens y P. indica) con marcadores moleculares mediante las técnicas de RAPD e ISSR, donde los productos de PCR fueron separados en geles de acrilamida. Las huellas deADN se analizaron con métodos estadísticos multivariadas y de remuestreo para conocer su relación genómica. Se detectaron fragmentos polimorfismos de ADN útiles para la distinción inter e intraespecífica de las ocho especies del género Persea en estudio. Los análisis estadísticos de las huellas de ADN mediante RAPD a diferencia de ISSR, agruparon de forma congruente a las diferentes especies de acuerdo a la taxonomía actual. De acuerdo al presente estudio, P. indica y P. lingue mantienen poca relación genómica con el resto de las especies estudiadas por pertenecen al subgénero Eriodaphne. Por otra parte los resultados permitieron diferenciar genotipos de las diferentes especies del subgénero Persea incluyendo a P. americana y un híbrido interespecífico incluido en el estudio.
 
Publisher Instituto Nacional de Investigaciones Forestales Agrícolas y Pecuarias
 
Date 2018-05-08
 
Type info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
 
Format application/pdf
 
Identifier http://cienciasagricolas.inifap.gob.mx/editorial/index.php/agricolas/article/view/1185
10.29312/remexca.v4i4.1185
 
Source Revista Mexicana de Ciencias Agrícolas; Vol. 4 Núm. 4 (2013); 517-529
Revista Mexicana de Ciencias Agrícolas; Vol. 4 Núm. 4 (2013); 517-529
2007-9230
2007-0934
 
Language spa
 
Relation http://cienciasagricolas.inifap.gob.mx/editorial/index.php/agricolas/article/view/1185/1035
 
Rights Derechos de autor 2013 Revista Mexicana de Ciencias Agrícolas
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
 

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